Etnis Madura mulai menetap di Kalimantan sejak program transmigrasi era kolonial (1902) hingga puncaknya pada masa Orde Baru. Gesekan Sosial:

Puncak tekanan nasional dan internasional memaksa Presiden Megawati Soekarnoputri mengambil tindakan tegas. Pada 2 April 2001, para tokoh adat Dayak dari berbagai sub-suku (Ngaju, Kayan, Iban, dll) bertemu di Tumbang Anoi, Kalimantan Tengah. Bersama perwakilan warga Madura yang selamat dan pemerintah daerah, mereka mengadakan rekonsiliasi adat besar-besaran.

Perang Dayak dan Madura terjadi sebagai akibat dari meningkatnya ketegangan antara kedua kelompok etnis tersebut. Pada awalnya, ketegangan ini muncul karena perbedaan budaya, bahasa, dan adat istiadat. Dayak, sebagai penduduk asli Kalimantan, memiliki tradisi dan struktur sosial yang berbeda dengan Madura, yang merupakan pendatang dari Pulau Madura, Jawa.